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ppt怎么绘制表格:分享一个PPT+Excel绘制KEGG通路热图的方法

多组学文章中，通路热图通常是一个不可或缺的展示结果，无论是作为一张主图，还是拼接图里的一个部分。涉及到转录，蛋白，代谢等等数据的，大家往往会用它展示核心通路的变化和富集情况。如下：

那么通路热图绘制是否需要复杂的R包或者在线的各种分析工具？

统统不需要，只需要最简单的PPT+Word即可。下面我们分享下具体该如何操作。

数据准备

1. 代谢通路的对应关系，基因ID，代谢物ID

通路中代谢物与基因的对应关系，可以来自于转录组，代谢组分析后的KEGG通路，或者来自于前人报道的文章。以比较简单的数据分析获得来展示。根据富集分析或者关键代谢物，关键基因共同确定的通路，获得通路ID（ko0***），通过联合分析结题报告的结果文件（图1）获得基因，代谢物对应关系。通过联合分析报告KEGG注释表格获得基因（ID），代谢物（ID）（图2）。

图1 KEGG通路展示结果

图2 KEGG通路基因，代谢物展示表格

2. 基因表达信息

依据上述通路得到的基因ID信息，通过转录组分析结果基因表达量列表提取出要展示样本的所有注释到的基因的表达量信息。

3.代谢物表达信息

依据上述通路得到的代谢物ID信息，在代谢组分析结果表达量列表里提取出要展示样本的所有注释到的代谢物的表达量信息。

通路图绘制

依据kegg通路图中代谢物及基因的上下游关系，在ppt上绘制代谢通路。箭头前端为代谢物底物，箭头后端为代谢物产物，基因在线头上面展示。

注：如果代谢物与代谢物之间不是由一个基因直接合成，而是经过多步合成的，一般使用虚线连接，如果是一步合成，则可以用直线连接。

FAQ：

1.要把通路上的所有基因和代谢物都绘制出来吗？

一般是只展示有差异表达的基因及关联的代谢物，有差异表达的代谢物及关联的基因，某个范围内，基因跟代谢物都无差异，为了图片的美观我们往往选择忽略。

2.如果一个通路上注释到的差异基因跟差异代谢物数量非常少画出来不好看怎么办？

首先在数据挑选时，优先选择注释的基因与代谢物数量多的通路，如果选定的研究通路确实数量比较少，可以参考下面文章的方法ppt怎么绘制表格:分享一个PPT+Excel绘制KEGG通路热图的方法，检索一下该通路的代谢物是否在其他通路里也有出现，以该代谢物为连接点，将两个通路联系起来。下图中，黄色方框与绿色方框分别为两个通路，以L-为连接点将抗坏血酸代谢通路和谷胱甘肽代谢通路连到了一起。

（ Sun et al，BMC ，2020）

热图绘制

根据上文拿到的基因表达量的信息和代谢物表达量的信息绘制热图。基因与代谢物的热图绘制方式是相同的，这里我们以基因热图绘制为例进行展示。

将基因表达量的结果以excel表的格式打开，在开始-条件格式中选择新建规则。

在新建格式里选择基于各自值设置所有单元格的格式-格式样式里选择双色刻度-类型选择最低值，最高值。颜色处，可对最低值选择一个颜色，最高值选择一个颜色，中间值即自动填充渐变颜色。

如果想让图片变得更美观一些，可以在格式样式里选择三色刻度ppt怎么绘制表格，类型处，最小值，最大值选择数字，中间值选择百分点值。最小值，最大值的值处填充表格里表达量的最小值和最大值。中间值的值处填50。三色颜色处可以根据喜好选择三个颜色。提前将预览处的颜色条截图，方便后续做图例。选择完成，点确定，即出现下方的填充颜色的表格。

调整单元格大小，使其符合热图里粘贴范围，将图例粘到下面，备注最大值和最小值。

Ctrl+A，表格全选，将表格背景颜色填充为白色。

去除Excel单元格数字：

选中填充颜色表格，右键选择设置单元格格式，选择数字，在自定义处，修改类型为；；；。点击确定。

填充表格添加黑色边框。选中填充颜色，击右键，选择设置单元格格式，在边框处选择全部边框黑色线条，点击确定。

输出热图。表格选择另存为pdf格式，将热图输出。

通路热图拼接

将绘制好的热图进行裁剪，粘贴前面ppt绘制的通路图的基因上去，ppt另存为PDF，后续可以根据发文需要，在上调整需要的分辨率。

至此，Excel+PPT版的通路热图的绘图工作就结束了，是不是并没有想象的这么难。有数据的可以尝试起来了。

参考文献：

[1] Sun J , Qiu C , Ding Y , et al. acid - in tea by the and [J]. BMC , 2020, 21(1).

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